DNADynamo - DNA测序和分析软件
DNADynamo是一款易于使用的DNA测序和分析软件。从各种格式和在线数据库导入或检索带注释的序列文件。组装测序数据,分析突变,并输出结果。设计cloning strategies,设计primers,并创建漂亮的质粒图,可以以任意方式进行编辑和调整。通过Clustal和Muscles插件支持DNA和蛋白质多序列排列。对齐是可编辑的。您使用DNADynamo的次数越多,随着您积累笔记、注释、寡核苷酸和测序数据,您的序列文件变得更加有用。DNADynamo支持复制和粘贴子克隆,它的构建器包括用于限制位点添加和自动引物设计gibson cloning和infusion cloning strategies。还支持TOPO、TA和网关反应。适用于分子生物学家在任意级别,使用DNADynamo在ncbi进行爆炸搜索,从entrez搜索和检索genbank文件,检索和显示pdb结构文件等。
DNADynamo DNA测序和分析软件可适用于Windows PC,包括Windows 7、Windows 10、Windows 11、MacOS/OS X 10.10.10 Yosemite、10.11 El Capitan、10.12 Sierra、10.13 High Sierra、10.14 Mojave、10.15 Catalina、11.0 Big Sur、12.0 Monterey和Linux。
DNADynamo软件功能:
序列导航和限制性位点分析
Genbank accession U52953代表'HIV-1 92BR025 from Brazil, complete genome' 导入DNADynamo并显示特征图
abi/scf色谱图序列排列和编辑
上方显示区的可编辑序列排序与下方显示区的色谱数据相联系。在翻译“指南“序列的同时,图形地图可以轻松实现测序差异的可视化,并说明从”特征“地图中选择的注释和oligos。
自动添加矢量特征并绘制地图
DNADynamo的圆形地图是可编辑的。你可以调整几乎全部东西的大小、颜色和位置,包括设置你喜欢的字体,以及添加自定义文本标签。DNADynamo地图还支持特殊的MCS显示,并允许你添加一个特征列表和/或一个不存在的限制站点列表。
使用片段复制和替换计划子克隆,或使用专用的“Construct Maker”
一个含有vpr基因的EcoRI/BamHI片段被选中。该片段可被复制,然后用于替换另一载体中选定的EcoRI/BamH1片段。
手动设计引物或使用引物设计器自动选择具有给定属性的引物,例如gibson/infusion cloning或添加限制性位点。
在Primer Designer中已经选择了一个片段,并设计了添加BamH1位点和EcoRI位点的引物。
附加功能:
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Oligo编辑器和数据库
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集成网络BLAST搜索和注释
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通过DNADynamo ClustalW界面进行注释的多序列比对
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模式搜索
【英文介绍】
DNADynamo DNA sequencing and Analysis Software is easy to use. Import or retrieve annotated sequence files from a variety of formats and online databases. Assemble sequencing data, analyse mutations, and export the results. Design cloning strategies, design primers, and create beautiful plasmid maps that can be edited and adjusted any way you want. Supports DNA and Protein multiple sequence alignments via Clustal And Muscles plugins. Alignments are fully editable. The more you use DNADynamo the more useful your sequence files become as you accumulate notes, annotations, oligos and sequencing data. DNADynamo supports copy and paste sub cloning, and it's construct maker includes automatic primer design for restriction site addition or seamless gibson cloning and infusion cloning strategies. TOPO, TA and gateway reactions are also supported. Suitable for molecular biologists at any level, use DNADynamo to blast search at ncbi, search and retrieve genbank files from entrez, retrieve and display pdb structure files, and more.
DNADynamo DNA Sequencing and Analysis software is available for Windows PCs including Windows7, Windows 10, Windows 11, MacOS/OS X 10.10.10 Yosemite, 10.11 El Capitan, 10.12 Sierra, 10.13 High Sierra, 10.14 Mojave, 10.15 Catalina, 11.0 Big Sur, 12.0 Monterey and Linux.
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