SnapGene - 分子生物学软件
· Dotmatics产品系列在中国区价格调整-北京睿驰科技
SnapGene是一款多功能的分子生物学工具,能够直观的注释分析和DNA图谱,用于创建和共享注释文件,帮助用户清晰地为分子生物学绘制相关图形,生物相关的用户不要错过!
SnapGene可帮助用户计划,可视化和记录您的日常分析生物学程序,并为大家提供更安全的方法,现在DNA构建体都可以用电子格式记录,它节省了大量的时间和金钱,并且方便使用者发现问题,制作决策和方案,软件界面友好,使用方便,是款很好的工具。
功能
DNA可视化
查看DNA序列的多个视图
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地图:自定义,酶位点,引物,ORF,DNA颜色等的显示。地图可以是圆形或线性格式
序列:使用双链模式查看酶位点,具有翻译,引物和DNA颜色。单链模式显示具有彩色的紧凑概览
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酶:从一系列酶组中选择。剪切网站可以显示为数字或行,按名称或频率排序
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功能:按名称、位置、大小、颜色,方向性或类型对带注释的要素列表进行排序。复选框在紧凑或展开的显示之间的切换。
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引物:按名称、位置、大小、颜色、方向性或类型对带注释的要素列表进行排序。复选框在紧凑或展开的显示之间的切换。
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历史:查看DNA构建体的自动生成的图形历史记录。
大序列
浏览染色体大小序列
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查看:利用SnapGene的数据处理功能,扫描具有数千个带注释功能的大型DNA序列
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搜索:使用的MICA算法即时在染色体内找到序列
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缩放:使用多功能控件调整缩放系数和显示区域
蛋白质可视化
查看蛋白质序列的多个视图
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地图:自定义区域、站点、键和序列颜色的显示
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系列:使用具有相关功能的1或3个字母的氨基酸代码查看蛋白质序列
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属型:查看蛋白质的分子量,消光系数,等电点和氨基酸组成。可以对蛋白质的选定部分进行相同的分析
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属性:按名字、位置、大小、颜色或类型对带注释的功能列表进行排序。复选框在紧凑或展开的显示之间的切换
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历史:查看自动生成的蛋白质序列图形历史记录。蛋白质或DNA序列可以作为单独的文件再生
直观的序列编辑
编辑DNA和蛋白质序列
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标准编辑:进行插入、删除、替换和大小更改。复制并粘贴序列时,会自动传输功能
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DNA结束:编辑线性DNA序列的末端以添加或去除突出端或磷酸酯
序列颜色编码
将选定的DNA或氨基酸序列设置为十种颜色之一
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给两条DNA链或蛋白质序列着色。颜色在Map和Sequence视图中都可见
属性注释
自动注释常用功能,或手动注释新颖功能
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自动检测:使用SnapGene广泛的数据库查找DNA序列中您选择的功能可以添加到自定义数据库中
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手动注释:选择DNA或蛋白质序列的一部分,并使用的GenBank兼容空间注释
模拟
SnapGene提供优雅、信息的窗口,用于模拟常见的克隆换个PCR方法
限制性站点指标:确认限制性网站适合克隆
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属性:以粗体显示的限制性位点或选择自动定义的Unique Cutters或Unique 6+ Cutters酶组
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甲基化敏感性:限制性位点被Dam , Dcm或EcoKI甲基化阻断。SnapGene将自动用星号标记该站点
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性质:利用工具提示来避免有问题的限制网站
限制性克隆
可视化克隆过程
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如果您已经准备好了过程,那么模拟需几秒钟。如果克隆过程存在设计缺陷,则可以捕获并纠正错误。
聚合酶链反应
模拟标准PCR
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使用您自己的引物,或要求SnapGene自动设计引物。产品文件在其历史记录上存储模板和引物。
重叠延伸PCR
通过重叠延伸PCR融合片段
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组装八个碎片。选择要连接的片段及其方向,SnapGene将设计引物。
引物定向诱变
使用诱变隐去进行定点诱变
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选择诱变引物,然后按按钮以查看修饰的质粒。历史颜色突出了突变。
网关®克隆
模拟网关®BP克隆或LR克隆,或两者在同一时间
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为了方便起见,提供了公共的供体向量和目的向量。选择要组装的片段,Snap Gene将设计引物。
Gibson组装
通过融合八个片段或通过将八个片段插入向量来模拟Gibson Assembly。Gibson Assembly是一种克隆方法。
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选择要融合的片段及其方向,Snap Gene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反向PCR产生。
IN-FUSION®克隆
通过将八个片段插入载体来模拟Clontech的In-Fusion克隆。融合克隆是创建基因融合的一种通用的方法。
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选择要融合的片段及其方向,Snap Gene将设计引物。线性化的载体可以通过酶消化或反方向PCR产生。
TA和GC克隆
通过TA或GC克隆捕获PCR产物
选择常规TA克隆或高校GC克隆
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为了方便起见,通过了常见的TA克隆载体和Lucigen的GC克隆载体。
退火寡核苷酸
将两个寡核苷酸退火以形成双链产物
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使用的控件添加突出端以进行限制性克隆。
避免错误
使用SnapGene的结构是正确的,并确认已获得的序列。
基因融合阅读框
构造中的翻框架中。
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链接的翻译
使用“序列”视图可以查看两个已翻译的要素是否在框架中。如果这样,翻译将链接在同一行上。如果不是,则翻译在单独的行上。
与参考序列比对
使用功能的对齐工具检查实际结构是否与模拟结构匹配。
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映射概述
查看比对序列与参考序列匹配的地方以及存在差异的概述。
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序列详细信息
自动记录
SnapGene自动记录操作以创建图形历史记录,并将原型构造在文件中。
“撤销”功能
撤销几何操作。
尝试SnapGene文件而感到—重复步骤。
历史和原型
查看构造的图形历史记录
单击操作以突出显示亲本和产物序列的相关部分,或单击PCR引物名称以查看引物序列。
在历史树中单击原型,以重新生成该原型序列文件,其注释和克隆历史记录。
历史颜色
使用可选的历史记录颜色来标识序列的更改
查看有关组装结构的详细信息,结扎的粘性末端。
拥有您的数据
SnapGene使您可以选择读取和共享文件,同时保持对数据的控制。
安全文件管理
将SnapGene文件保存在的位置。
使用计算机上熟悉的安全操作系统来存储和组织SnapGene文件,
从格式导入
读取常见的文件格式
导入DNA序列,还导入注释。将继续开发进口商,以您不会被锁定的文件格式。
导出为标准格式
将序列,图谱或凝胶图像转换为标准格式。将地图或模拟的穷糖凝胶导出为常见的图像格式。
与SnapGene Viewer共享数据
需将文件和链接发送到SnapGene Viewer。就像的SnapGene界面一样,收件人将能够看到图,序列和注释。
SnapGene 7.0引入了更新的外观和增强的数据管理功能。使用选项卡轻松导航文件和文件夹,并直接从新文件夹面板执行基于序列和元数据的文件搜索。其他增强功能包括新的引物插入注释和各种可用性改进。
选项卡式界面
使用新的选项卡式界面在文档之间导航,或将文档弹出到单独的窗口中以进行比较。
文件和文件夹管理
选择文件系统上的任意文件夹作为项目,并直接在新的可折叠文件夹面板中快速查看子文件夹和文件。执行标准文件运作并快速浏览所有支持的文件类型。
文件搜索
通过灵活、现代的界面,使用名称或类型、包含序列、特征注释等属性在项目中快速查找文件。
入门注释
在更新的添加/编辑引物对话框中可视化添加到引物的插入,例如酶、密码子或短肽序列。感兴趣的区域(Golden Gate限制位点、Gateway克隆attB位点、定向TOPO基序)现在也为自动设计的引物进行了注释。
预览检验到的新序列特征
新的文件窗格现在包含一个序列图,用于预览序列中检验到的特征,并允许您选择要包含在序列中的注释。
开始
使用新的“入门”窗格快速访问近来的文件和文件夹,或通过指向短视频教程、用户指南文章和SnapGene学院的链接了解有关如何使用 SnapGene 的更多信息。
系统操作要求:
Windows
SnapGene 5.1 - 6.0:Windows 7或更高版本(64位仅适用于Intel)。
SnapGene 6.1 - 7.0:Windows 10或更高版本(64位仅适用于Intel)。
基于ARM的计算机构建的Windows不支持SnapGene。
macOS
SnapGene 5.2.5或更早版本:macOS 10.12。
SnapGene 5.3 - 6.0:macOS 10.13或更高版本。
SnapGene 6.1 - 7.0:macOS 10.14或更高版本。
基于Apple ARM的计算机原生支持SnapGene 6.1版及更高版本。
Linux
SnapGene 4.0 - 5.2:Ubuntu 16.04、RedHat 6.6和7.2。
Snapgene 5.3 - 6.0:Ubuntu 18.04、CentOS 7 (1810)或RedHat 7.6。
SnapGene 6.1 - 7.0:Ubuntu 20.04、CentOS 8 (2105)或RedHat 8.4。
为基于ARM的计算机构建的Linux 不支持SnapGene。
硬件要求
内存 | 1GB以上 |
硬盘 | 250MB可用磁盘空间 |
显示 | 分辨率1440×900或分辨率 |
- 2024-10-30
- 2024-10-22
- 2024-10-18
- 2024-10-12
- 2024-09-30
- 2024-09-27
- 2024-11-01
- 2024-10-18
- 2024-10-16
- 2024-10-14
- 2024-10-09
- 2024-09-29