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HYDRUS是运行于Windows系统下的环境模拟软件，主要用于变量饱和多孔介质的水流和溶质运移。用于模拟变量饱和多孔介质下的水、热和多溶质运移的二维和三维有限元计算以及土壤的水压和溶质运移参数的逆向估计。

地下水模拟系统(Groundwater Modeling System)，简称GMS，是一款在综合MODFLOW、FEMWATER、MT3DMS、RT3D、SEAM3D、MODPATH、SEEP2D、NUFT、UTCHEM等已有地下水模型的基础上开发的综合性用于地下水模拟的图形界面软件。GMS已正式面向大中华区用户发布官方简体中文版。当前新版未为GMS 10.8，包含中文软件界面、菜单、对话框及教程等。

Visual MODFLOW Flex是模拟三维地下水水流，热传递和污染物运移的标准化软件。该软件实现了概念模型和数值模型的转化，具备的二维和三维可视化功能，易于操作。

Flo-2D可用来模拟洪水灾害，适用于都市淹水、洪水平原管理、工程设计、不规则形状河道水理演算、桥梁涵洞水利演算，可以处理都市水文，泥石流。