Clone Manager - 分子生物学软件

Clone Manager Professional提供了一套集成的工具，用于酶操作、克隆模拟、图形图绘制、引物设计和分析、全局和局部序列比对、相似性搜索和实验室规模的序列组装项目。

您还可以使用Clone Manager作为一种快速、简单的方法来查看或编辑序列文件、查找开放阅读框、翻译基因、查找文件中的基因或文本，或者使用引物或序列短语集合。

分子查看器窗口将所有分子信息集中在一个方便的位置。点击窗口底部的标签，可查看分子图谱、限制性图谱数据、序列、特征表或分子信息。

分子查看器窗口，地图视图

连接视图

Clone Manager就像一个系统，帮助你进行克隆模拟、酶操作和图形绘制。Clone Manager会查找限制性酶切位点、切割分子、修改末端和连接DNA。

在所有这些操作中，Clone Manager都会跟踪你的特征和酶切位点，并自动对新分子中的位置重新编号。快速而强大的限制酶分析功能将帮助你找到酶来完成所需的操作。一套克隆向导可以帮助你使用当前的克隆技术模拟克隆。

分子图形地图绘制快速准确，高分辨率地图可发送到打印机或Windows剪贴板，供其他应用程序使用。使用图形地图的 "增强视图 "自定义特殊分子地图，以便在演示文稿或出版物中使用。额外的字体、颜色、样式和线宽控制可帮助您制作一些特别的地图。

Clone Manager Professional可用于执行多序列比对、局部比对和序列相似性快速扫描。该程序可胜任处理大量分子和大序列。比对结果显示在一个标签式查看窗口中，结果可以打印或复制到Windows剪贴板。您还可以为实验室规模、简单或复杂的项目组装序列，或定位亚克隆。

Clone Manager Professional可以在目标区域找到optimal primers的 "简短列表"。您还可以在目标位置的分子序列中定位引物，并查看引物评估、引物侧翼序列、附近的基因以及符合设定标准的邻近引物的位置。使用测序引物向导（Sequencing Primer Wizard）设计一组引物，对分子区域进行测序。将引物保存到磁盘上的内置收集文件或引物文件中。搜索引物集，找到与任意感兴趣分子上的结合位点相匹配的引物。

克隆操作

• 模拟克隆
• 绘制图形地图，增强视图
• 使用酶
• 序列分析功能
• 克隆向导：Gateway、Gibson、In-Fusion、NEBuilder、拓扑异构酶、Golden Gate、Crispr 敲除、PCR等

引物设计、分析

• 设计引物，创建扩增产物
• 分析引物、分析混合物
• 找到与您的分子结合的引物
• 组织、使用馆藏中的引物

对齐操作

• 对齐多个序列
• 比较两个序列
• 扫描相似性、BLAST搜索
• 组装序列，定位亚克隆

其他特性

• 集成序列编辑器和文件处理程序
• 广泛的序列格式化选项
• 序列短语集合、引物集合、内置DataBook数据库
• 使用云存储服务共享分子

【英文介绍】

Clone Manager Professional provides a comprehensive, fully integrated set of tools for enzyme operations, cloning simulation, graphic map drawing, primer design and analysis, global and local sequence alignments, similarity searches, and laboratory-sized sequence assembly projects.

You can also use Clone Manager as a quick and easy way to view or edit sequence files, find open reading frames, translate genes, find genes or text in files, or use primer or sequence phrase collections.

Cloning Operations

• Simulate cloning
• Draw graphic maps, Enhanced views
• Work with enzymes
• Sequence analysis functions
• Cloning wizards: Gateway, Gibson, In-Fusion, NEBuilder, Topoisomerase, Golden Gate, Crispr knockout, PCR and others

Primer Design, Analysis

• Design primers, create amplified products
• Analyze primers, analyze mixes
• Find primers that bind to your molecule
• Organize, use primers in collections

Alignment Operations

• Align multiple sequences
• Compare two sequences
• Scan for similarities, BLAST searches
• Assemble sequences, locate subclones

Other Features

• Integrated sequence editor and file handler
• Extensive sequence formatting options
• Sequence phrase collections, primer collections, built-in DataBook database
• Share molecules using cloud storage services