FCS Express - 流式分选分析软件
· Dotmatics产品系列在中国区价格调整-北京睿驰科技
为什么使用FCS Express?
想学习FCS Express?你已经开始了!
知道如何使用Microsoft PowerPoint吗?Excel怎么样?
学习如何使用流式细胞术软件不应成为数据中获取结果的障碍。FCS Express的设计外观、感觉和工作方式与很多熟悉的Microsoft Office程序相似。
从FlowJo切换到FCS Express?
如果您发现自己经常需要将表格和图形复制并粘贴到其他软件包,那么FCS Express可能就是您的理想选择!
集成电子表格使分析变得简便
想象一下,拥有Excel的强的功能,结果直接链接到您的大门。使用FCS Express电子表格可以直接在您的分析中访问并链接到您的跟前和数据文件。随着移动和数据的变化,您的电子表格也会实时变化。
FCS Express特点
FCS Express流式细胞术和图像细胞术软件专注于将您的流式细胞术和图像细胞术数据转化为结果。
FCS Express使您能够使用工具进行快速数据分析、创建可发布的图表、提供门控工具等。通过直接导出为PowerPoint、PDF、Excel、Word和高分辨率图像格式,更快的获得结果。
Pipelines
FCS Express中的Pipelines是一组独立或串联的数据处理步骤。一个步骤的输出可以用于数据文件或用作下一步或一系列步骤的输入,这些步骤可能应用于您的数据。没有插件,没有编程,只有结果!
绝大多数常用的数据分析算法实际上都是pipelines,tSNE(及其变体)和SPADE就是两个例子。但是,当这些算法作为一个计算来实现时,用于自定义只限于特定实现所允许的范围。FCS Express中的pipelines增加了运行算法和数据转换的计算灵活性和粒度,同时为用户提供了创建自己的转换和能力。
Pipelines由单独的数据处理步骤组成,每个步骤执行特定的计算/转换。
预定义的流水线步骤(FlowAI、FlowCut、FlowSOM、SPADE等)使访问常用算法和数据处理步骤变得简便。
FCS Express提供了多种流水线步骤供您选择。
综合电子表格
您是否曾想要将文件、gates和图表中的统计数据直接链接到Excel?FCS Express提供集成的电子表格,当gates和数据使用tokens实时更新gates或数据变化。
拖放gates种群以填充电子表格。从数据列表中提取很多数据文件到电子表格中,以比较样品并自动生成结果。
您已经知道如何使用电子表格。
使用很多您知道的高等Excel工具(包括条件格式)自定义电子表格,以便您可以更轻松、更快速的获得结果。
寻找公式函数?FCS Express为您提供了Excel中提供的很多相同公式。
电子表格公式提供开始分析所需的全部详细信息。跳过手动查找并直接查看结果!
出版就绪的图形
对于您的数据,出版质量的结果很紧要。每次您以多种格式以任意分辨率分析样本时,FCS Express都会提供可发布的图形。
适合您分析的正确绘图总是触手可及。
在分析时或通过创建默认值自定义绘图的各个方面,以便您准备好立即从原始数据转移到您的出版物。
使用自定义标签和网格线或刻度线格式化您的任意轴。
使用黑白或灰度图来避免彩页费用。
Clinical Edition
FCS Express IVD是在FDA上市的第三方流式细胞仪数据分析软件。De Novo Software通过创建和遵守政策和程序以满足21 CFR §820的严格要求和复杂法规,致力于FCS Express的高质量。
使用统计分类器自动对数据进行定性评估。
使用条件语句和标记来自动控制何时运行批处理操作。
用预设评论描述分析和结果。拖放以将您的解释添加到布局和批处理到LIS。
使用带时间戳的电子签名验证分析和布局状态。
CFR 第11部分合规性
通过结合日志记录功能,确保您的流式细胞术数据分析符合CFR第11部分。除了复杂的加密、打印日志记录、打印标记、密码老化和很多其他功能外,FCS Express还可以节省时间和很多合规性工作。
在用户和布局级别控制软件中的数百个操作。
记录所做的每一个工作。登录FCS Express会生成带有时间戳的数字文件,记录为审核所做的每项操作。打印或另存为PDF以存档审计跟踪。
为您的用户创建电子签名以验证布局状态并将信息直接导出到您的LIS。使用tokens,可以强制执行签名指令,其中需要先签署来自一个特定签名组的签名,然后才能允许来自另一个签名组的签名。
在审计跟踪中跟踪和报告系统级操作并增强您对法规要求的遵守。
光谱分析
利用能够显示来自Cytek和Sony仪器的光谱数据的第三方软件。
应用gates沿着光谱可视化感兴趣的子集。
创建gates以进一步分析人口或早其他地块上设置gates。
在单个图中叠加多个样本或群体,以便于进行视觉比较。
直接在FCS Express中从单一染色对照执行光谱分离。当对补偿设置和/或直接矩阵进行调整时,您的流式细胞术分析将立即更新,以帮助您立即根据您的控制可视化变化。
还可以为添加布局的任意已创建或导入的分解矩阵创建可视化矩阵。FCS Express将生成一个可视化矩阵,只需在补偿和取消混合编辑器中右键单击所需的取消混合矩阵,选择构建可视化矩阵。可视化矩阵页面包括一个带有图表值的电子表格和一个显示检验器与强度的图表,用于在自动分离设置中添加的每个单一染色控制。
FCS Express使查看未混合的光谱特征变得简单方便。可视化矩阵是众多新功能之一,可使您在FCS Express中的分析更上一层楼。
图像细胞术
借助FCS Express Image Cytometry,利用广泛使用的流式细胞术数据分析工具来加速您的图像细胞术分析。进一步使用图片绘图和数据网格,单击一下即可从种群深入到单个细胞。
在Picture Plots中对图像感兴趣的区域设置门控,并查看分析在其他门控的反向设置。
选择感兴趣的单元格或在数据网格中创建单元格库。
数据转换-tSNE/SPADE/k-means等等...
数据转换允许您通过FCS Express中的各种算法创建自定义参数,并直接与R集成。转换导航器是一个直观的对话框,可以通过快速拖放轻松的将转换应用于绘图。
通过易于使用的界面生成令人惊叹的tSNE/viSNE图。
从您的数据创建SPADE树,这些树会随着gates和数据的变化而实时更新。
集成的k-means工具简化了聚类分析。
主成分分析在转换导航器中可用。
当您的分析需要定制方法时, 直接在FCS Express中执行R脚本 。
轻松补偿
FCS Express允许您通过读取数据文件、手动调整或使用控件从头开始构建来轻松创建和应用补偿。
以您需要的任意方式加载和编辑补偿。
使用您的单染和未染色对照快速进行自动补偿设置以创建补偿。
使用滑动条或在补偿导航器中定义辅助因子,直接从图中快速编辑的调整补偿。每当影响补偿设置或矩阵本身发生任意变化时,结果都会实时更新。
溢出扩散矩阵(SSM)和交叉染色指数(CSI)矩阵均在补偿/分离向导结束时自动计算。
批量处理
使用批处理不只可以加速大量样品的批量分析,还可以通过单击创建PDF、PPT、XLS等。
使用相同的门控策略分析样本时同时生成报告文件。
在FCS Express IVD中使用条件语句和标记控制何时运行批处理操作。
通过自定义其选项,定义如何以及在何处保存从批次创建的每个报告。
统计数据
通过使用标准统计 、统计测试或在FCS Express中创建自定义计算来节省时间。使用集成电子表格以类似于Excel的格式获取统计信息。当gates移动或数据更改时,所有值将实时更新。
通过将统计数据添加到批处理过程中,避免将统计数据写在纸上以供进一步分析的单调乏味。
在布局中的任意位置插入统计信息 - 图表、文本框、自定义表格和 电子表格。
使用FCS Express IVD中的分类器根据统计数据进行实时更新的定性评估。
细胞周期分析
通过使用Multicycle AV进行细胞周期分析,清理繁琐且通常有偏见的手动门控 。FCS Express的每个副本中都包含一个不需要费用的版本,可以显示三个周期的Pro版本可以购买。
您的样本将按照门控或非门控数据的显示进行建模。
自定义多周期图以显示您的结果,以便共享或报告您需要的方式。
解释指南和统计数据可以插入到布局中并包含在批处理中。
增殖分析
使用FCS Express中的集成建模,避免手动定义增殖数据的世代。该模型使用复杂的linear least-squares拟合过程,提取您需要的信息和统计数据。
使用自定义配色方案让您的数据有效起来。
或者...
简化图形以黑白或灰度发布。
调整拟合参数以优化数据建模。
有关模型拟合的统计数据和信息可以插入到布局中并包含在批处理中。
BD部门和Accur汇入
导入BD FACSDiva和Accuri仪器的实验, 无需在采集后重新创建绘图和门控,从而节省时间。根据需要更新门控策略或自定义图,并运行批处理以从实验中的所有样本创建结果。
Diva to FCS Express
- 所有采集模板和分析工作表
- 原生、高分辨率、浮点FCS数据
- 所有具有适当门控层次结构的门
- 所有补偿设置
- 所有标记和象限
Accuri to FCS Express
- 收集和分析选项卡上的所有图
- 原生、高分辨率、24 位 FCS 数据
- 所有具有适当门控层次结构的门
- 所有补偿设置
- 所有标记和象限
- 所有绘图格式设置
Accuri
FCS Express
高内涵筛选
使用 FCS Express中的热图轻松可视化和分析基于板的数据集、索引排序以及流式和图像细胞术分析的筛选。
在单个图中表示多个样本的多个统计数据和参数。
应用gates以只显示感兴趣的事件或创建gates以聚合感兴趣的孔/样本,例如重复。
选择配色方案并定义颜色级别以自定义您的热图并使其脱颖而出。
让FCS Express为您的热图中的全部或选定的孔和簇自动创建门控。
质量控制
FCS Express提供质量控制工具来标准化您的数据分析并提高整个团队的一致性。
通过IQ/OQ程序确保FCS Express的安装、配置和操作正确,以便您验证工作。
按需或在批处理期间自动运行质量控制检查并发出警报。
使用权限规则定义允许哪些操作、由谁以及何时进行。结合标准操作程序 (SOP) 构建器来标准化分析。
控制对象(图、门、页面等)何时在布局上可见。
合并数据文件
合并数据文件是在单个图上加载和可视化多个文件的便捷方式,在 FCS Express中执行转换时特别有用。文本信息或分类文件标识符可用于识别合并数据文件中包含的每个数据文件。分类文件标识符现在可以显示在二维图上,以便使用门和/或标记直接识别特定文件。FCS Express使处理合并的数据文件变得无忧无虑。
记住缩放公式
FCS Express会记住手动调整的缩放比例。用户不再需要调整每个图,一旦对图参数进行了更改,所有显示相同参数的图都会自动更新。优化数据在绘图上的显示方式从未如此简单。
操作系统:
Windows:FCS Express 7可在Windows 7/Windows 8/Windows 8.1/Windows 10/Windows 11上运行。
- 32位 FCS Express将在32位或64位环境中运行。
- 64位 FCS Express将在64位环境中运行。
Mac:
如果使用 FCS Express 7:
- macOS 13 (Ventura) 尚未全部验证是否支持FCS Express 7。
- 请注意,要在macOS 13上运行FCS Express 7,请确保关闭“Stage Manager”。
- 当与macOS 11.6或更高版本一起使用时,FCS Express 7.10.0007及更高版本支持基于ARM的Mac(M1 Apple Silicon)。
- 支持macOS 10.13 (High Sierra) 到macOS 11.x (Big Sur)。
- FCS Express 7.12.0005、7.12.0007及更高版本支持macOS 12.2.1 (Monterey)。
- 如果使用macOS Monterey 12.3。和Monterey版本,兼容FCS Express 7 v7.12.0009或更高版本。
- macOS与网络许可证不兼容。
- 如果使用FCS Express 6,则支持macOS 10.8 (Mountain Lion) 到macOS 10.14 (Mojave)。
- FCS Express 5或更低版本可以在Mac上的 Windows虚拟机环境中运行,使用Parallels、VMWare Fusion或Boot Camp等软件。
【英文介绍】
FCS Express™ gets you from raw data to easily-understandable, beautifully formatted, presentation-ready results more easily and in less time than any other flow cytometry software.
Why Use FCS Express?
Want to Learn FCS Express? You've Already Started!
Know how to use Microsoft PowerPoint™? How about Excel™?
Learning how to use flow cytometry software should not be an impediment to getting results from your data. FCS Express is designed to look, feel, and work like many familiar Microsoft Office™ programs so you are already half way to being an expert with the software before you even get started.
Making the switch from FlowJo™ to FCS Express?
If you are currently using FlowJo and are having trouble arriving at publication quality results, find it hard learning an unfamiliar software interface, find yourself constantly having to copy and paste tables and graphics to other software packages, then FCS Express might be just what you are looking for!
Integrated Spreadsheets Make Analysis Easy
Imagine having the power of Excel with results linked directly to your gates. With FCS Express spreadsheets can be accessed directly in your analysis and linked up to your gates and data files. As gates move and data changes, so do your spreadsheets in real time. Say good bye to copy and paste and hello to results!
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