PRIMER - 生态学数据分析软件

数以千计的研究人员信赖PRIMER在多变量分析中的创造性和清晰度。

分析可行安全的非参数方法中受益的生态数据或数据

PRIMER大量用于生态学数据的处理，它是一套多变量数据的统计分析包，特别是物种组合，理化变量，基因，微生物，生物指标，饮食，RS，建模等数据。

PRIMER V7提供了广泛的单变量，图形和多变量例程从社区生态学分析物种逐样本数据的数组。数据通常丰度，生物量，%面积（或线）的覆盖，存在/不存在等。并在环境影响的生物监测和更基础的生态研究中出现。还照顾物理值和化学浓度的矩阵，其本身或生物组合数据并行分析，例如，以检查生物变化与物理化学条件的共同变化。

尽管对于生物组合数据分析要求是一个原理焦点，所述包装是同样适用，其是多变量或可被视为这样的数据结构。

该统一特征是数据集可以是根据他们的组合，生物标记套件，粒度分布，生长曲线的形状等，将每个样本对的形式简化为的三角矩阵，然后聚类和排序能够显示样本之间的关系，和排列测试用于检验假设。

PRIMER V7的特征是能够基于分类的不同或亲缘物种组成计算生物多样式指数。这些例程允许正式的假设测试在一个地点（按物种列表的分类“宽度”的平均和变化），从一个更大的区域物种中“预期”的变化。V7提供了一种可能的方法，当取样工作不受控制时，将生物多样性模式与广泛的空间和时间尺度进行比较。

强大的

这些方法很少假设数据的形式。非度量排序和置换测试是该方法的基础，该方法易于实现且易于解释。

广泛适用

对方法的解释性和透明度的信息解释了为什么在海洋，陆地和淡水生态学，林业，土壤科学，遗传学，水产养殖，分类学，微生物学，医学，经济学等领域采用PRIMER。

操作数据和结果

PRIMER工作区（*.pwk）

• 在单个交互式和直观的图形Windows环境中同时处理多个数据集，图形和输出文件。

• 使用树状导航窗格跟踪工作

• 输入/输出来自Excel , .csv , .txt或3列格式的数据

• 在屏幕上查看和更改绘图和图形的颜色，字体，外观和感觉

• 复制 / 打印 / 导出结果为.jpg , .emf , .tif , .gif , .png , .bmp , .rtf文件

• 指定分析的能力和性

• 确定样本或变量的子集

• 定义测试和显示的组结构

• 处理相对较大的数据集（于可用的Windows内存）

• 合并或CIA分指定条件的数据

• 释放内置向导的省时功能，用于矩阵显示和核心分析

排序

用于可视化数据，包括主成分分析（PCA）技术协调，加上非十进制，度量或阈值度量的多维度（NMDS , MMDS , tmMDS）。在二维或三维可视化高维数据。自定义文本，颜色和符号。使用叠加层添加基本信息，例如群集，轨迹，气泡，图像，矢量或微小生成树。

使用bootstrapping在MDS图上显示置信区域。旋转，展开，旋转，动画，保存和分享您富有洞察力的图像。

聚类

执行分级聚类成样品基团，具有单，，组平均的或柔性的-β键选项。

创建通表象距离矩阵和情节树状图。自定义，旋转，放大或打印出来多个页面来捕获细节，的配置文件（SIMPROF）和相关的排列检验鉴定样品或物种群，分裂聚类方法可以是不受约束的（UNCTREE），或受环境变量约束，而krCLUSTER执行非均衡版本的k均值聚类。

阴影图和热图

使用选择的灰度或色谱以2d或3d显示实际值。

凸图案露出自如。样品和变量可以根据不同的标准，梯度，聚类约束或分组进行排序。

标签和读好易于球盖和定制。

非参数测试

基于排雷的假设检验使用性分析（ANOSIM），测试来自不同的时间，位置，试验处理等多变量样本组之间的差异。PRIMER的算法现在支持这些非参数测试的大多数三向设计。确定物种主要提供两组样品。之间的辨别为系列化，在时间和空间上连续的数据的曼特尔型试验。

相关矩阵彼此或识别的，他们一起产生的变量的子集与给定度矩阵匹配的“较好”Mantel类型匹配。

置换测试包括可变的选择步骤，以严格的统计推断。

生物多样性分析

使用分类学，功能和系统发育信息来为生物多样性评估提供信息。测试范睢使用子采样算法主名单。

计算经典和新颖的多样指数或单个变量的汇总统计的众多，具有聚合工具在分类分析数据，访问的绘图功能，广泛的选择。各个变量：线，柱状图，散射，框，装置，表面或曲线绘图员生态学的工具是在之间，诸如显性图，几何类情节，或丰度的生长量曲线。