Peakfit - 光谱分析拟合软件
PeakFit当前新版本为V4.12
Systat PeakFit是一款数据峰值拟合软件,通过该软件用户可以的将数据导入软件进行分析,为用户拟合出各项数据的峰值,该软件大多数数据文件格式导入您可以利用软件中的数据扫面功能将该分析数据运用在软件中,当您创建新的峰值时,可以将计算的数据重新导入分析项目,完成重建该数据的峰值,新版中PeakFit可以自动和地放置正和负幅度峰值的混合,用户要在进行分类设置了,方便。
PeakFit通过三种方式自动放置峰值
PeakFit使用三个过程自动放置隐藏峰。尽管每种方法都是的解决方案,但一种方法对某些数据集可能比方法更好。
残留过程起初是通过在平滑数据流中找到局部大值来放置峰。然后可选择地将隐藏峰添加到残差中出现峰的位置。
二阶导数过程在平滑的二阶导数数据流中搜索局部小值。这些局部小值通常会显示隐藏的峰。
反卷积过程使用具有傅里叶反卷积/滤波算法的高斯响应函数。成功去卷积的光谱将由等效面积的“锐化”峰组成。目的是增强隐藏峰,以使峰都代表局部大值。
如果PeakFit的自动放置功能在其复杂或嘈杂的数据上失败,则要单击几下鼠标即可图形化地放置和拟合峰。放置的函数都有“锚”,可调整复杂的函数,自动更改该函数的数字参数。PeakFit 的图形放置选项可以像高斯曲线一样平滑地处理复杂的峰。
使用PeakFit的可视化FFT过滤器,您可以检查傅立叶域中的数据流和零个的频率点 - 并立即在时域。这种平滑技术可在保持原始数据流性的同时,实现出色的降噪效果。
PeakFit还自动FFT方法以及高斯卷积,Savitzky-GOlay方法和Loess算法进行平滑。整个平滑选项和程序部分的AI会自动帮助您进行调整。而且,PeakFit具有数字数据增强器,可帮助您分析稀疏数据。有PeakFit提供了不同的数据处理方法。
PeakFit的非参数基线拟合例程可去除DNA电泳样品的复杂背景。PeakFit还可以减去八个内置方程,也可以减去您开发并存储在文件中的基线。
软件功能
1、PeakFit的参数约束
“适应Preferences”选项内置参数约束,这些约束基于与峰的初始位置定义的值的变化。这些约束的默认值严格,适合提供具有大量明确定义的峰的光谱或色谱数据。如果在拟合期间在“约束”字段中看到重复的非零值,则可能需要打开这些约束或谨慎地禁用它们。
2.背景配件
要在后台执行峰拟合,将“数值拟合”或“图形拟合”窗口进行小化。由于PeakFit使用单独的适配线程,所以前台性能不应该受到影响。
3.直接删除峰
在“自动修正峰”选项中,现在可以直接通过双击其主锚点直接删除峰。也可以使用删除峰的文档中描述的步骤,右键单击峰的主锚点,然后在弹出对话框中左键单击“删除峰”按钮。
4.正振幅峰值和负振幅峰值的混合
PeakFit现在可以自动和地放置正和负幅度峰值的混合。此功能存在于AutoFit Peaks I Residuals选项中。选中允许负值。当允许负幅度峰值时,禁用自动添加正残余峰值的选项。仍然可以通过在期望峰的中心位置附近的残差图中点击来添加单个残差峰。您可能需要预先减去基线或使用线性渐进基线选项,因为常数零二阶导数程序在存在负振幅峰值时失败。
5.部分重新扫描
当您在自动调整峰值选项之一中创建自定义峰值展示位置时,可以更改控制面板设置,而重建峰值。检测到自定义调整时,将显示扫描或部分扫描的选项。扫描将清除自定义调整。部分扫描将使用当前峰值计数和位置作为新的峰值放置的基础。除了当前默认峰类型之外的峰在部分扫描中保留。
6.从AIA文件导入过程数据
AIA保留时间的过程数据的色谱文件可以在自动修正峰选项中导入。 “读取扫描设置和参数估计”选项还提供AIA CDF文件类型。选择要导入的峰分析结果的AIA文件(PeakFit将使用峰计数和保留时间值)。过程数据的文件要与数据拟合相同,但保留时间在要拟合的数据的范围内,以便作为峰放置。当更改重新扫描的选项时,选择部分扫描,以保留导入的峰值计数和位置。如果选中“变化宽度”或“变化形状”,则这些保留时间将通过PeakFit进一步细化。
7.从ASCII文件导入峰值位置
您还可以创建ASCII文件,其中您PeakFit放置峰的峰位置。这在三个AutoFit Peaks选项中可用。 “读取扫描设置和参数估计”选项还提供了用于导入峰值位置的外部列表的ASCII TXT文件类型。使用ASCII文本编辑器创建文件,或者您可能从自定义程序生成文件。列出峰值位置每行。这些位置在拟合数据的范围内。每当发生重新扫描时,选择部分扫描,以保留导入的峰值计数和位置。如果选中了变化宽度或变化形状,这些峰值位置值将通过PeakFit进行细化。
8.具有二次模型的非参数数字滤波器
当您使用带有二次模型的PeakFit非参数数字滤波器时,建议使用5个点的数据窗口。对于噪声数据,当使用4点的小数据窗口时可能出现不。
9.鼠标放大复位
在PeakFit图形中单击鼠标右键,远离数据点或峰锚点,现在将当前放大的清除。默认缩放的重置不再发生。
10.数值摘要中的分析领域
分析区域是具有闭合形式解的区域。 PeakFit对其大多数峰函数具有闭合形式的分析面积公式,这些公式在数值摘要的“测量值”部分中报告。例外是高斯 - 洛伦兹交叉积函数,Pearson IV函数,对称双累积,非对称双S型和非对称双累积。对于这些函数,对于峰分析区域的“数值摘要”报告“未知”,并且省略分析面积。对于这些功能,您将需要依靠数字的领域。除非峰具有超出数据的X范围的宽的尾部,否则分析和数字积分区域将基本上相等。
11.将数字摘要添加到打印输出
当在固定和自定义纵向模式下打印图形时,此选项可用。数字摘要直接打印在图表下方。对于8个或更少的峰,报告两个拟合参数和缩写的测量值。对于8个峰,打印测量值。字体缩放自动适合指定区域。此选项在PeakFit的审阅中可用。
12.打印输出中的线宽
将图形打印到高分辨率输出设备时,用于绘制峰的单宽度线可能显得太浅。这些线可以通过增加线宽来变暗。由于该宽度无法在有限的屏幕分辨率内表示,因此打印预览不会反映此线宽设置。
13.拟合高斯和洛伦兹导数
您现在可以数字地放置高斯或洛伦兹峰的一阶或二阶导数。这些功能使用正确的鼠标弹出窗口选择。这些列为D1(高斯放大器),D2(高斯放大器),D1(Lor Amp)和D2(Lor Amp)。函数严格地由基础高斯或洛伦兹的参数的数值设置。自动放置和图形调整不可用。
作为拟合导数的替代,您可能考虑使用PeakFit的累积面积选项的值,以初次数据,然后使用PeakFit的自动化直接拟合峰。由于导数中的噪声通常在综合基线中产生不寻常的趋势,因此在拟合之前,您可能在AutoFit基线选项中使用PeakFit的非参数过程。通过激活被判断为表示真实基线的那些点,非参数模型可以地拟合和去除这种类型的基线。数值摘要的测量值部分将报告基于底层峰值而不是导数的分析区域。注意,大多数测量值对峰型数据,并且在拟合导数时没有意义。
软件:
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PeakFit使用三个程序自动放置隐藏的峰值;虽然每种方法都是一种的解决方案,但有些数据集可能比方法更好。
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Residuals过程开始通过在平滑数据流中找到局部放置峰值。然后可选的添加隐藏的峰值,其中出现残余峰值。
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二阶导数过程在平滑二阶导数数据流中搜索局部小数值。这些局部小数值经常揭示隐藏的峰值。
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去卷积过程使用具有傅立叶反卷积/滤波算法的高斯响应函数。成功解卷积的范围将等效面积的“尖锐”峰值。目标是增强隐藏的峰值,使峰值代表局部大数值。
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如果PeakFit的自动放置功能在复杂或嘈杂的数据上失败,您点击几下鼠标即可以图形方式放置和拟合峰值。放置的函数都有“锚点”,可以调整复杂的函数,自动更改函数的数字参数。PeakFit的图形放置选项可以平滑的处理复杂的峰值,如高斯峰值。
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PeakFit提供复杂的数据处理,使用PeakFit的可视FFT滤波器,您可以检查傅里叶域中的数据流和零点的较高频率点-并立即在时域中检查。这种平滑技术可在保持原始数据流性的同时实现出色的降噪效果。
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PeakFit还自动FFT方法和高斯卷积,Savitzky-Golay方法和用于平滑的Loess算法。AI会自动帮助您在整个平滑选项和程序的部分中设置调整。此外,PeakFit还有数字数据助推器,可以帮助您分析稀疏数据。有PeakFit通过了不同的数据处理方式。
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PeakFit的非参数基线拟合程序可以去除DNA电泳样品的复杂背景。PeakFit还可以减去八个内置基线方程,或者它可以减去您开发并存储在文件中的基线。
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公布的质量图表都是使用PeakFit的内置图形引擎创建的-现在打印预览和一些文件和剪贴板导出选项。数字输出可自定义。
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PeakFit为您节省宝贵的研究时间,对于大多数数据集,PeakFit将为您完成工作。过去花了几个小时、几分钟-现在点击几下鼠标。新手可以学习如何使用PeakFit。PeakFit数据处理技术可以解决复杂或嘈杂的数据集。
软件
卷积
当不同的过程根据两个不同的和独立的扩散函数加宽峰时,所得到的峰被认为两种不同功能形式的卷积。卷积的数学形式由积分组成:
例如,光谱峰由榷状态洛仑兹展宽和独立的高斯仪器展宽形成。高斯和洛伦兹的卷积是Voigt函数,该模型比卷积的各个分量复杂得多。
卷积模型
两个不同峰值函数的大多数卷积对于卷积积分缺少闭合形式解。 PeakFit的内置峰值函数集三种具有分析形式的不同卷积模型,光谱函数集内的Voigt,以及色谱函数中的EMG和GMG。
卷积模型的之处在于拟合函数的参数直接描述了卷积中的分量。这是在峰值拟合内实际发生的反卷积形式。这是很有吸引力的方法,因为它地解决卷积积中的两个分量,而不会引入噪声,并且可以重叠和隐藏峰值。
解卷积
解卷积本质上是卷积的撤销或逆转。它通常在傅里叶域中用离散数据完成,并且通常去除仪器响应函数。反卷积的FFT形式涉及使用一些形式的频域过滤来处理的噪声的主要引入。
仪器响应函数
当不的测量仪器有助于峰值展宽时,描述该效应的函数被称为仪器响应函数。大多数去卷积的目的是去除器械拖尾,以便产生没有仪器失真的信号信号。
解卷积光谱或高斯仪器响应函数
大多数光谱仪器响应函数在形式上倾向于是高斯的。因此,大多数光谱峰将由它们的榷状态洛伦兹形式和该高斯拖尾的卷积组成。独立的高斯和洛伦兹展宽可以通过拟合Voigt模型来解决。您还可以通过使用高斯响应函数对傅里叶域中的数据进行反卷积来去除高斯拖尾。
“准备菜单”中的Deconvolve Gaussian IRF选项提供了自动化的FFT高斯反卷积程序,可用于在拟合之前删除仪器效应。
PeakFit的应用:
PeakFit是光谱、色谱或电泳的自动选择
PeakFit的建议用途如下所示,但是,PeakFit可用于科学、研究或工程学科。
用于光谱学
PeakFit可让您准确检测、分离和量化标准仪器可能一楼的隐藏峰。PeakFit包括18种不同的非线性光谱应用线形状,包括高斯、洛伦兹和Voigt,甚至是用于拟合伽马射线峰的高斯加康普顿边缘模型。作为曲线拟合过程的产物,PeakFit报告每个峰的幅度(强度)、面积、中心和宽度数据。总面积是通过对整个模型中的峰值方程进行积分来确定的。PeakFit 甚至可以解卷积您的光谱仪器响应,这样您就可以分析您的数据,而不会产生仪器带来的拖尾现象。
电泳用
PeakFit 使电泳用户能够快速轻松地分离、定位和测量多达 100 个峰(带),即使它们重叠。有 82 个非线性峰值模型可供选择,您几乎可以保证找到适合您的数据的方程。复杂的基线类型数组使您可以集成数据中波段的部分。然后这些测量结果会自动记录在 PeakFit 生成的报告中,或者可以以图形方式显示。
用于色谱
PeakFit 包括 8 个不同的内置方程,用于色谱数据中常见的不对称峰,包括指数修正高斯、Haarhoff-Van der Linde、NLC、Giddings 甚至半高斯修正高斯,这是一种类似于EMG,但用于描述柱内起源的不对称性。峰面积作为这些函数中的每一个中的参数直接计算,以确保准确性并能够计算置信限。PeakFit 报告色谱柱效率、分离度、一阶矩(质心)、二阶矩、中心(模式),以及基峰和半峰的峰宽,以及基峰和较大值的 10% 的不对称性。PeakFit 甚至可以解卷积您的色谱检测器响应,因此您可以在没有仪器引起的不对称性的情况下分析您的数据。
用于信号成分分析
尽管 PeakFit 被化学家、生物学家等广泛使用,但不少电气工程师发现 PeakFit 的统计非线性拟合技术对于分离重叠信号很有用。
真正的 Voigt 函数
在光谱学中,仪器和多普勒展宽效应会产生高斯线形,而自然和碰撞展宽会导致洛伦兹线形。Voigt 函数是高斯函数和洛伦兹函数的卷积。大多数提供 Voigt 函数的分析包都使用精度很有限的近似值。PeakFit 实际上使用封闭形式的解决方案来准确地分析计算函数。PeakFit 有四个不同的 Voigt 函数,因此您可以拟合您感兴趣的参数,包括高斯和洛伦兹分量的单独宽度,以及 Voigt 函数的幅度和面积。PeakFit 对 Voigt 函数的准确计算对于分析的准确性有用的。
光谱、色谱和电泳的非线性峰分离和分析
PeakFit 比您的实验室仪器更好、更准确、更方便地分离和分析非线性峰数据——原因如下:
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非线性曲线拟合技术可分离标准仪器遗漏的重叠峰
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峰值查找和拟合是自动化的!PeakFit 具有三种不同的程序来准确表征正常峰和隐藏峰
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当您想要覆盖 PeakFit 的自动化时,自己以图形方式拟合峰值
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数据平滑和操作技术可准确处理嘈杂的数据
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革命性的常数零秒导数基线拟合程序找到适合基线——PeakFit 还包括一个用于复杂背景的非参数模型
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82 个内置非线性方程(18个用于光谱学,8个用于色谱法)和多达 15 个用户定义的函数几乎适合全部数据
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一次拟合 100 个峰
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使用 PeakFit,您的准确度将会提高,并且您会比以往更快地找到并拟合您的峰值
不要猜测或依赖硬件制造商生产的非专用软件的准确性。PeakFit 远远超过峰值分析包!
PeakFit产品功能说明
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ASCII
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Excel
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Lotus 123
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Quattro Pro Windows
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SigmaPlot
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AIA Chromatography
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dBase III+, IV
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DIF
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ASCII和电子表格—如编辑器
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平均数字滤波器
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高斯反卷积去除分光光度计仪器响应拖尾
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指数去卷积以色谱检测器响应拖尾
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平滑(Savitsky Golay,FFT滤波器,Loess,高斯卷积)
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实时FFT/时域图形编辑器
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具有图形数据点排除功能的双图形数据分段
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非参数数字过滤器,用于过滤或扩充数据
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与参考比较
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减去从文件导入的基准
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数据转换
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面积归一化
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检查二阶和四阶导数
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数据加权
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由本地Maxima和残余自动执行
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由二阶导数自动生成
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通过反卷积自动变大化
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图形放置和调整
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共享和锁定参数
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一步即可恒定或可变宽度和/或形状
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Marquardt—Levenburg算法
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83个内置的非线性模型
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偏小二乘和3个Robust(大数值似然)方法
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100个峰和1000和参数
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智能约束合身
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稀疏曲率矩阵,可更快拟合
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数值和图形拟合选项
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拟合期间放大或切换点
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具有生成的数据的文件导出:Lotus 123,Excel,Quattro Pro Windows, SigmaPlot和ASCII
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图形以BMP或WMF格式写入剪贴板或文件
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图形到剪贴板中电子表格格式的数值数据
运行PeaKFit的要求:
硬件:
486处理器或
需要16 MB RAM(建议32MB或以上)
10MB硬盘空间
软件:
Windows 10,8.x,7,Windows Vista,95,98,NT和XP(32位)
- 2024-11-19
- 2024-11-12
- 2024-11-08
- 2024-11-07
- 2024-11-05
- 2024-10-30
- 2024-11-15
- 2024-11-14
- 2024-11-01
- 2024-10-18
- 2024-10-16
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