一款PCR引物设计软件-Primer Premier

1、多方位的设计支持

Primer Premier 通过先进的搜索算法，结合蕞近邻法计算精准的解链温度，可自动筛选出较优的常规PCR、多重PCR及SNP基因分型引物。在结果汇报前，系统会对引物的二级结构、二聚体、发卡结构、同源性及物理性质进行多方位检Ce，并按优先级排序建议适合目标序列的引物。用户可直接从NCBI导入目标基因，设定搜索范围后即可由Primer Premier 自动筛选出甄选引物方案。

2、自动规避同源性及模板结构干扰

Primer Premier 能自动解析BLAST搜索结果，并运用自有算法检Ce可能的二级结构，有效规避同源区域与复杂结构区域，确保设计出高特异性、高 效率的引物。

3、多重检Ce与SNP基因分型

针对多重PCR实验，Primer Premier 支持批量模式下的引物搜索，并自动进行引物间交叉反应性检验，有效减小非特异性扩增风险。在SNP基因分型实验中，可精准设计位于SNP侧翼区域的引物。

4、灵活多样的引物设计与分析功能

通过手动搜索选项，用户只需点击模板序列上的任意核苷酸位点，即可获取该区域的引物设计方案。Primer Premier 实时分析引物各项属性，并对预先设计的引物进行性能评估与优先级排序，帮助用户判断引物与理想指标的吻合度。此功能特别适用于对已发表或经实践验证的引物进行优化分析。程序还可为指定引物自动设计配对的正向或反向引物。

5、数据管理与系统支持

- 直接通过GenBank与dbSNP数据库的编号/ID批量获取序列到程序内

- 执行BLAST及模板结构检索，在设计过程中自动规避同源序列与二级结构

- 支持本地及桌面BLAST选项，便于使用内部定制/未公开数据库

- 提供序列可视化界面，标注引物位置并高亮显示同源区与模板结构

- 支持引物对或单条引物性能评估，自动设计配对引物，并可导出HTML/csv格式完整分析报告

- 支持模板序列编辑：可新增碱基或删除指定区域

- 生成可直接用于发表的实验方案报告，便于团队协作

- 内置计算工具：快速计算GC含量、碱基数及获取互补链/反向互补链

- 采用项目化管理模式，本地化存储序列信息与搜索结果数据库

- 兼容Windows 7与Mac Snow Leopard等主流操作系统