SnapGene7.2.0和7.2.1更新:引入全新功能与优化,加速分子生物学研究效率

 

本文介绍了 SnapGene 7.2.0 和 7.2.1 版本的更新内容。7.2.0 版本引入了引物同源二聚体计算功能,并增强了文件标签管理和用户界面交互。7.2.1 版本则专注于修正多个 Bug,改进稳定性和性能。这些更新大大增强了 SnapGene 的使用体验,使其在分子生物学研究中的应用更加便捷和快速。

 

 

SnapGene 7.2.1版本修正内容

 

  • 改进导入引物时的稳定性。
  • 改进捡测常见特征时的稳定性。
  • 修正搜索项目时可能发生的各种卡顿问题。
  • 改进在没有网络连接时的稳定性。
  • 修正在色谱图中进行选择和扩展选择时的各种问题。
  • 修正在 Windows 上处理远程文件(UNC 路径)时的问题,例如文件无法显示在文件和文件夹面板中或重掵名后无法打开。
  • 在模拟 Golden Gate 克隆时,确保数值起点保留。
  • 修正单击调整段终点时旋转框继续旋转的问题,尤其是在添加/编辑特征对话框中。
  • 修正用于执行 BLAST 工作的网络链接。
  • 更新 StayGold 和人类 U6 启动子序列到常见特征数据库中。
  • 修正 Windows 11 上无法更新的问题。
  • 更新中文和日文的翻译。

 

 

SnapGene 7.2.0版本修正内容

 

概述:

 

  • 计算引物同源二聚体结构 - 通过 Primers 视图中的“显示结构”按钮查看引物的自二聚结构及其 deltaG 值。

 

 

  • 拖动文件标签 - 通过将文件标签拖入或拖出窗口创建多个标签窗口,轻松对序列进行分组。

 

 

  • 用户体验改进 - 改进标签、文件和文件夹的导入和交互,优化当前标签和文件名的可见性,优化色谱图的默认视图设置等。

 

 

  • 新增常见特征和琼脂糖凝胶梯 - 可选择来自多个供应商的凝胶梯,并在标准特征数据库中添加了更多可捡测的特征。

 

 

新增功能与增强:

 

  • 引物同源二聚体 - 使用 Vienna RNA 包中的 RNAcofold 工具计算引物同源二聚体结构,并可按序列或置信度可视化同源二聚体。
  • 标签窗口增强 - 允许文件标签在窗口之间拖动;可创建多个包含文件标签的窗口;标签窗口可以在没有“项目”面板的情况下存在。
  • 项目界面中的数据管理增强 - 可将文件直接导入子文件夹;增加了文件面板菜单中的“展开/折叠所有文件夹”指令;右键单击文件面板中的单个文件时,增加了“打开文件”指令。
  • 色谱图跟踪文件视图设置增强 - 调整了默认高度,避免峰值在标签窗口中拉伸;当鼠标悬停在质量数据上时显示峰值信息;当鼠标悬停在跟踪文件序列上时显示碱基突出显示。
  • In-Fusion 克隆的默认设置更新 - 当有多个片段时,更新默认使用 20 bp 片段,符合 Takara Bio 的新建议。
  • 新增琼脂糖凝胶模拟中的梯 - 添加了 BioGate、GeneAll GENESTA 和 Hylabs 的凝胶梯。
  • 常见特征数据库更新 - 添加了 Anderson 启动子组、Bxb1 整合酶及其相关位点、多个荧光蛋白特征、Csy4 和人类 U6 启动子序列。

 

其他更改和修正:

 

  • 改进性能,避免在编辑参考 DNA 序列或比对序列时重新计算比对。
  • 添加进度对话框,并允许在对参考 DNA 序列进行比对时取消cao作。
  • 在导入 FASTQ 测序读取时,允许用户指定质量格式。
  • 在次级结构视图中添加侧边工具栏。
  • 改进在暗模式下编辑 DNA 末端对话框的外观。
  • 修正在蛋白质比对视图中显示的错误底链碱基复制选项。
  • 通过右键单击文件名打开非本机文件。
  • 修正多个项目文件中捡测常见特征时可能导致的崩溃问题。
  • 修正在项目面板中进行文件搜索时可能导致的崩溃问题。
  • 修正在原点跨越的区域搜索时可能导致的崩溃问题。
  • 修正了在集群中进行批量编辑后无法恢复祖先的问题。
  • 修正了在跨越数值起点的位点上模拟 Gateway 克隆时发生的错误。
  • 确保在使用限制性片段插入时,载体特征传输到产品中。
  • 优化在创建新文件、添加常见特征时捡测序列拓扑的性能。
  • 实现了新算法用于搜索和索引序列,并针对核心分子生物学用例优化了性能。
  • 这些更新进一步加强了 SnapGene 的性能和稳定性,同时改进了用户界面的可用性。

 

 

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2024-09-03 10:00
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