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PyMOL - 分子可视化软件

PyMOL 3 · Molecular Visualization

PyMOL 分子可视化软件

用于观察、分析与展示蛋白质、核酸及其他分子的三维结构,并通过图像和动画呈现分子结构信息。

从结构查看到图像表达的可视化工作环境。

PyMOL 将三维分子结构浏览、表示方式调整、相互作用与标签展示、场景保存及动画制作整合在同一界面中。研究人员可围绕关注的结构区域组织视图,制作可重复调整的科研图像与演示内容。

三维结构呈现查看蛋白质、核酸及其他分子结构
图像与动画光线追踪图像、场景与时间轴
工作方式图形界面操作与 Python 扩展

核心功能

分子三维结构查看

展示蛋白质、核酸及其他分子的空间结构,围绕研究对象调整视角与结构表示,便于观察不同区域的空间关系。

相互作用与结构标注

在视图中突出关注的相互作用、结构表示及关键标签,用于说明结合区域与结构特征。

光线追踪图像

使用光线追踪呈现结构的深度与阴影,并可按图示需求修改视角和表示方式,制作论文、报告与演示所需的分子图像。

场景保存与调用

将当前工作区视图保存为场景,通过缩略图识别不同场景,便于在多个结构视图之间切换和调整。

时间轴与动画

把场景加入时间轴并组织为分子动画,用动态方式展示三维结构及视角变化。

Python 扩展

除图形界面外,PyMOL 提供基于 Python 的开发与定制方式,可用于扩展可视化工作流程。

PyMOL 3 界面中的分子结构、场景面板与时间轴
PyMOL 3 界面:结构视图、场景与时间轴
PyMOL 展示蛋白质与配体的结合姿态
蛋白质与配体结合姿态示例
PyMOL 绘制带有透明表面的 DNA 结构
DNA 结构与透明表面示例
PyMOL 绘制 p38 蛋白结合结构
p38 蛋白结合结构示例

适用场景

结构生物学研究

查看蛋白质和核酸的三维结构,围绕感兴趣的区域组织结构视图与标签。

分子相互作用展示

结合结构表示与标注,呈现配体结合姿态及相关结构信息。

科研图像制作

制作适用于论文、报告与演示的分子结构图,并在需要时调整场景和图像表达。

教学与学术演示

通过场景和时间轴组织结构视图,将空间结构变化制作成演示动画。

运行平台与授权

Windows

PyMOL 3 支持 64 位 Windows 11。

macOS

支持 64 位 macOS 13.0 及以上版本;Apple Silicon M1–M4 设备使用 Rosetta 2。

Linux

支持 64 位 Linux;官方列有 Rocky / Red Hat Enterprise Linux 8 及以上、Ubuntu 22.04 及以上等环境,要求 glibc 2.28 及以上。

PyMOL 商业版采用授权使用方式,许可文件由 Schrödinger License Manager 生成。开放源代码项目与商业版的下载、授权和支持方式不同,具体选择应以实际使用需求及授权方案为准。

服务支持

可提供 PyMOL 正版授权采购、许可方案咨询、部署建议、授权续费和售后技术支持服务。

采购说明

产品价格会因用户类型、授权方式、购买数量及服务内容等因素发生变化。如需报价,请以双方确认的实际方案与成交价格为准。

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