Oligo数据库功能详解

数据库窗口允许您创建并保存新数据库,用于存储寡核苷酸及寡核苷酸组数据。它同时也是一个强大的分析和多重搜索工具。完成任一寡核苷酸搜索后,您可将全部或部分找到的寡核苷酸导入数据库。

 

 

数据库窗口

 

数据库以表格形式显示。右侧列展示每个寡核苷酸的分析数据:蕞强二聚体自由能、兼容性(SC表示自兼容)、引发效率(P.E.)和解链温度(Tm)。当数据库与序列关联时,会显示绝 对的P.E.和Tm值,以及考虑错配的相对值(p.e.和tm)。您可以勾选或选择寡核苷酸或寡核苷酸组,随后进行二聚体和发夹结构分析,或导出到其他序列。您还可以运行搜索以查找所有交叉兼容的引物组(多重数据库)。搜索完成后,当您选择一组交叉兼容引物并点击Select按钮时,将显示如下界面:

 

 

数据库多重筛选

 

同一组引物在单一反应体系中不应相互干扰。数据库拥有独立参数设置,与旧版Oligo软件不同,您可在不打开源序列文件的情况下直接打开数据库并分析寡核苷酸。此时将无法计算真实的P.E.和Tm值——界面会如上图所示显示短横线。

通用且省时的动作是对完整引物组进行多重筛选。

 

 

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2025-12-08 15:00
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