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SnapGene 丨 分子生物学软件

SnapGene是一款强大的多功能的分子生物学工具,能够非常直观的注释分析和DNA图谱,用于创建和共享丰富的注释文件,帮助用户准确清晰地为分析生物学绘制相关图像,生物相关专业的用户不要错过!


新功能

  • 添加了用于DNA和蛋白质序列的成对比对的工具

  • 添加了用于模拟定向和钝性TOPO克隆的界面

  • 提供了对自定义背景窗口颜色的支持

  • 添加了拖出并查看对比序列的非对比末端的功能

  • 添加了以小写形式显示要素翻译的功能

  • 将比对显示在参考DNA序列的指定链或区域

  • 添加了直接从Ensembl导入序列的功能

  • 启用了一个或多个翻译特征的密码子频率的计算和保存

  • 启用的功能可见性可按功能类型切换

  • 添加了在导入序列迹线以进行重叠群装配或多序列比对时修剪低质量末端的选项

  • 使对齐的DNA可用于外显子和内含子注释特征

  • 添加了对打开DNASIS文件的支持

  • 增强的BLAST支持提供五个选项(blasyh , blastx , tblastx , blastp和tblastn)

  • 查看参考序列的比对时,更新了“比对序列”菜单,并添加了以下命令:在新窗口中复制所选序列,删除序列,显示/隐藏序列迹线的质量数据

  • 在“首选项”中添加了一个空间,以参考DNA序列比对时默认显示序列迹线的质量数据

  • 使多重DNA比对的选定部分能够转换为多重蛋白质比对

  • 添加了一个控件,用于将几何中的选定文件导出为PDF或制表符分隔格式的列表

  • 在“模拟琼脂糖凝胶”对话框中添加了“选择DNA序列”按钮,作为配置的快捷方式

  • 可以将氨基酸序列复制为1或3个字母的氨基酸代码

  • 启用复制成对或多个对齐窗口中跨越多行的选区的功能

  • 添加了新英格兰生物实验室的“TriDye®超低范围DNA”


增强功能

  • 计算具有间隙的特征的段的总长度,该信息现在显示在“特征”视图,特征对话框和特征工具提示中

  • 通过使用图标减小了收集界面中“代码编号”列的宽度

  • 添加了通过退出“编辑要素”对话框时调整其阅读框来保留要素翻译的选项

  • 在“首选项”中添加了一个选项,以在道尔顿的蛋白质文件中显示选择的MW

  • 如果子啊组装重叠群时未包含某些输入序列,则添加了一条通知

  • 添加了键盘快捷键,用于从列表中导入引物

  • 放宽了禁止在引物名称中使用<和>字符的限制

  • 改进了T7启动子功能的检测

  • 改进了从NCBI的导入范围,以容忍左端点和右端点交换的区域,识别“c”表示反向互补

  • 增加了对新遗传密码的支持

  • 改进了与参考DNA序列比对的 算法

  • 改进了从geneXplain生成的BED和GTF文件中导入特征的功能

  • 增强了VectorNTI数据库导入程序以识别分隔符

  • 在用户界面中提供了对齐程序(例如MUSCLE)的版本号

  • 通过包括在DNA线以下延伸的线,提高了选择及其端点在地图中的可见性

  • 增强了“编辑MW标记列表”对话框,以支持按供应商显示MW标记,并允许从供应商处一步选择MW标记

  • 在“功能”视图中,具有许多功能的序列很大地改善了滚动性能

  • 蛋白质窗口中的“增强的属性”视图列出了平均分子量和单同位素分子量

  • 使对齐对话框变为无模式,以允许切换到其他SnapGene窗口

  • 通过从选择的每一端向下延伸蓝线,提高了多对其窗口中共识选择的可见性

  • 进行了广泛的优化,以加快应用程序的总体启动和使用速度

  • 从WebKit切换到QtexEdit以进行富文本控件

  • 改进了对功能限定符合“描述面板”字段中链接的支持

  • 增强了“TA和GC克隆”对话框,以允许通过单击按钮来解决简单问题

  • 改进了用于切换与参考序列对齐的序列的可见性的空间

  • 改进了在显示对齐的序列迹线为双链DNA或色谱图之间切换的空间

  • 添加了一条警告,当计算多序列比对时,只有Clustal Omega才能保留内部终止密码子

  • 使用“保存到主集合 ”时,如有必要,可以指定一个主集合

  • 浏览集合是,在“视图”菜单中添加了“列表视图”和“文件夹视图”命令

  • 将“设计综合构造”和“订单构造”命令移至“工具”菜单

  • 合并了文件类型(DNA,蛋白质,比对)的默认字体大小设置,并增加了比对默认字体大小的支持

  • 鼠标悬停在序列迹线中的一个峰上时,改进了使用“选择/Alt”查看四个碱基高度的发现性

  • 在“工具”菜单中添加了“管理密码子使用表”命令,因为以前只能从“密码子使用表”对话框中访问此选项

  • 确保及时在为显示完整说明的情况下,“功能”视图中也可以看到丰富的格式(粗体,斜体,下划线,上标和下标)

  • 在“DNA计算”窗口中添加了“GC含量”值

  • 启用了将凝胶图像,地图和历史记录导出为macOS上的EMF矢量格式,以导入到Microsoft Office产品中的功能

  • 在“功能”菜单中添加了“显示/隐藏功能”命令

  • 确保从NCBI导入时,将LOCUS字段用作默认英文名

  • 添加了使用Cmd / Alt +单击在多重比对窗口中的共识和比对序列之间转移选择的功能

等等......


软件特色

  • 为DNA和蛋白质序列添加了多个工具

  • 实现了macOS的选项卡式窗口支持

  • 已启用将CSV格式的数据库导入集合

  • 为LabArchives ELN添加了文件交换工具

  • 允许的序列跟踪导出为FASTA和纯文本格式

  • 添加了Biotium MW标记物。添加了“ψ29 - HindIII”MW标记

  • 添加了“λDNA - EcoT14I”MW标记

  • 添加了Enzynomics MW标记

操作系统

  • Windows 7或更高版本

  • macOS 10.10或更高版本

  • Fedora Linux 21或更高版本

  • Red Hat Linux 7.2或更高版本

  • Ubuntu Linux 14.04或更高版本

  • 1GB内存

  • 硬盘 250MB可用磁盘空间

  • 显示1024 X 768或更高分辨率

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