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分子生物学软件SnapGene v6.1新功能

SnapGene v6.1为克隆和可视化提供了新功能:亮点包括在模拟Golden Gate Assembly时简化的引物设计、用于ssRNA序列的新二级结构视图,以及在全部操作系统中支持黑暗模式。


Golden Gate Assembly使用新工具模拟Golden Gate Assembly,可以自动设计Golden Gate Assembly的引物和悬垂,优化反应保真度,以很大程度的提高成功的可能性。



RNA二级结构

使用新的二级结构视图可视化您的单链RNA序列如何折叠,该视图显示由ViennaRNA Package计算的理想结构。



深色模式

SnapGene用户界面现在支持黑暗模式。默认情况下,将与您的黑暗模式或光明模式操作系统设置相匹配。



导出的选项

使用选项中的新导出面板自定义如何将内容导出到GenBank,包括LOCUS字段标识功能导出选项。



支持Apple Silicon

SnapGene现在可以在装有M1芯片的Apple电脑上运行。



SnapGene 6.1的更改:


提高:

  • 在描述面板中为Source属性添加了“Synthetic Protein”和“Unknown”选项

  • 添加了来自OriGene的DNA阶梯

  • 梯形片段长度现在显示在琼脂糖凝胶的片段列表中

  • 将LOBSTR添加到大肠杆菌菌株列表中

  • 在显示消息时提供取消选项,指示在继续编辑或复制一个或多个功能之前要解决未知或未安装的自定义功能类型

  • 添加了SnapGene Academy的链接

  • 广泛的优化

  • 各种文本和布局增强


修复:

  • 提高稳定性

  • 修复了各种内存泄漏

  • 修复了打开一些GenBank文件的问题

  • 当手动清除任一酶时,确保克隆对话框中的片段列表继续刷新

  • 改进了macOS上标点字符后的文本间距

  • 修复了阻止酶视图“选择范围”上下文菜单命令工作的问题

  • 改进了收藏窗口中的链接时的鼠标指针形状

  • 修复或改进了SnapGene.com页面的各种链接

  • 修复了克隆对话框在生产产品时可能会卡住的问题

  • 修复了某些窗口在Windows上省略了标题栏的问题

  • 修复了所选密码子在序列视图中并不总是使用白色前景显示的问题

  • 修复了添加或删除片段后仍显示“准备克隆”的问题,即使不再可能克隆

  • 导出线路时使用选项中指定的默认文件格式

  • 修复了Geneious文件导入的问题,其中蛋白质序列中的特征可能被错误的翻译

  • 修复了Geneious文件导入的问题,其中导入的核苷酸序列中的内含子被翻译

  • 修复了当组合框或行编辑专注于macOS时,小键盘中的Enter键没有响应的问题

  • 导出为EMF格式时提高了图像质量

  • 改进了Windows上复选框的显示

  • 修复了Windows中的下拉菜单有时会被剪切的文本

  • 修复了对话框中默认按钮的显示和行为问题

  • 修复了可以选择文件时在macOS文件资源管理器中显示为禁用的问题

  • 修复了阻止粘贴到macOS上“打开”和“另存为”对话框中的“查找”控件的问题

  • 修复了阻止将文件名中包含保留字符的AddGene序列导入Windows上的集合的问题

  • 更正了在将缺少标题的CSV格式的数据库导入集合时导致窗口很宽的问题

  • 修复了添加引物命令可以将引物添加到打开的 DNA 窗口的问题,即使在触发命令时收集窗口处于活动状态也是如此

  • 修复了在翻译中突出显示氨基酸选择的问题

  • 修复了 Ubuntu 上的问题,即如果已安装,则集合中的 AB1 文件会在 SnapGene Viewer 中打开

  • 修复了对话框在奇怪位置打开的一些问题,例如在不同的显示器上

  • 解决了编辑集合描述时的稳定性问题。

  • 修复了从 NCBI 导入混合内容类型的问题

  • 修复了从 NCBI 导入时序列名称的各种问题,尤其是在使用 COMPLEMENT 运算符时。

  • 修复了 Windows 上“更改甲基化”对话框中转换链菜单的外观。

  • 改进了 Windows 上的打印边距。

  • 改进了 Windows 上多序列对齐的打印质量。

  • 改进了“插入密码子”对话框的默认高度。

  • 改进了琼脂糖凝胶文档中显示的片段列表中文本的水平对齐方式。

  • 改进了多序列对齐中站点特征标签的显示。

  • 修复了浏览或编辑的通用功能无法在“浏览通用功能”对话框中与全部相关限定符一起显示的问题。

  • 在检测共同特征时,可重复地尊重“检测准确的蛋白质匹配或近似的 DNA 匹配”设置。

  • 在 Windows 上打印时改进的边距

  • 修复了在 Windows 上打印时酶名称的水平对齐问题。

  • 改进了 Windows 上旋转框的宽度。

  • 避免在 Windows 上省略菜单命令

  • 修复了导致难以在 Windows 上安装软件更新的各种问题。

  • 改进了在 macOS 上安装软件更新时进度条的行为。




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