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ProMass | 生物分子解卷积和报告软件

ProMass是一种自动生物分子解卷积和报告软件包,用于处理Thermo Scientific的Xcalibur或Waters MassLynx数据系统上采集的ESI / LC / MS数据或单个ESI质谱图。ProMass被设计用于高通量应用。

 

当用电喷雾(ESI)离子化时,大的生物分子主要是多电荷的。当以正离子模式分析时,由于碱性氨基酸和氨基末端,肽或蛋白质将在多个位点质子化。另一方面,作为酸性磷酸骨架的结果,以负离子模式分析的寡核苷酸在多个位点被去质子化。这种多次充电通常导致包含一系列电荷状态的ESI质谱。这些复杂的光谱必须“解卷积”或“转化”,以便确定生物分子的不带电荷的质量。 ProMass为执行整个LC / MS数据集的解卷积提供了一个自动化平台。

 

ProMass从一开始就设计用于高通量应用。实际上,运行ProMass的正常方式是通过Xcalibur或MassLynx示例列表。因此,您可以运行样品列表,让ProMass在最后处理它们,或者在您方便的时候批量重新处理列表。 ProMass使用称为ZNova的新型去卷积算法,可产生无伪像的解卷积质谱图。 ZNova可用于处理各种生物分子(包括蛋白质,寡核苷酸,肽等)的数据。与其他许多反卷积算法不同,ZNova可以适应低电荷状态谱和低信噪比的数据。 ProMass自动地以任何网页浏览器的易用和交互式格式报告结果。顶级摘要页面汇总了多次运行的结果,并将其显示在单个超链接页面上,以便您快速浏览结果。目标质量特征允许您自动从LC / MS数据中搜索多个目标质量数。目标质量特征包括结果颜色编码,使您可以快速磨合可能需要进一步关注的样品。

 

特征:

ProMass不仅仅是解卷积软件。ProMass是一个工具,允许您以高度协作的基于Web的格式处理和传达您的结果。

 生物分子质谱自动去卷积以确定分子量:适用于蛋白质,多肽,寡核苷酸等

ProMass版本适用于Thermo Xcalibur或Waters MassLynx数据系统

使用专有ZNova算法的无伪影解卷积,无需手动干预去除伪像峰

适用于低S / N谱

适用于高和低电荷状态谱(例如,对肽和蛋白质起作用)

在去卷积之前自动应用光谱平滑和基线去除

用Xcalibur处理方法处理LC / MS峰。例如,可以在N个最大色谱峰上处理数据,在相对强度阈值以上的所有峰等。

处理Windows剪贴板上的光谱数据

自动化的基于Web的报告,包括总结报告,色谱图(UV和MS),原始质谱图和解卷积质谱图

自动计算目标寡核苷酸和多肽的预期质量

颜色编码的结果显示,顶级汇总报告和样品盘查看器可以快速查看结果

自动搜索多个目标群体,并以颜色编码的基于Web的摘要报告结果

色谱图自动标记有基峰解卷积质量

ESI光谱自动标记有最丰富组分的电荷状态

峰值列表和日志文件为每个解卷积频谱自动生成,包括有关质量,标准偏差,分数和解卷积参数的信息

处理配置文件或质心数据..

直接输出到显式指定的文件夹,基于输入文件名或基于日期

包括用于参数设置,序列设置和处理方法验证的GUI

基于Web的报告可以使用自己的公司标识进行定制

基于Excel的总结报告选项

ZNova核心算法通过其命令行界面完全可编写脚本,允许您根据需要创建自己的应用程序。

包含一整套上下文相关的在线帮助(标准的HTML帮助格式)

现在有一个新的基于网络的演示版本,您可以免费试用!

从寡核苷酸或蛋白质序列自动识别末端或内部片段

支持鉴定来自多个寡核苷酸或蛋白质序列的片段(例如双链体)

支持指定修饰的寡核苷酸

支持“模糊”靶标物质,如PTM或蛋白质药物缀合物

在基于Web的报告中对列进行动态排序

目标质量纯度估计从反卷积峰计算


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